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膀胱癌依旧深不可测?| 用户文章

黄蒙慧 联川生物 2022-05-21

1研究背景

已有研究表明,microRNAs(miRNAs)在膀胱癌的肿瘤发生和恶化发挥重要作用。然而,个人和小样本研究易造成结果的差异性,基于miRNA微阵列数据分析膀胱癌组织miRNA性能分析的全面调查还未见报道

2研究目的

广西医科大学林星谷和陈迎春领衔的课题组运用miRNA微阵列芯片技术,膀胱癌瘤组织和配对的正常组织进行了miRNA的差异性能分析。

3研究结果

课题组通过miRNA微阵列技术,对来自于519个膀胱癌组织样本的miRNAs进行了差异表达的性能分析筛查。在21个已发表的微阵列数据集中优先选出11个候选miRNAs,使用vote-counting strategy 和 Robust Rank Aggregation算法进行分析。其中5个下调(miR-133a-3p,miR-1-3p,miR-99a-5-p,miR-490-5p和miR-133b)和6个上调(miR-182-5p,miR-935,miR-518e-3p,miR-573,miR-100-3p,和miR-3171)miRNAs。随后,对在硅片目标预测和潜在通路富集分析中的miRNA进行了膀胱癌的肿瘤发生分子机制的调查。异常表达miRNAs的研究发现,其大部分相对路径与不同的生物过程,细胞成分,分子功能,癌症发病机制,一些细胞信号(如Wnt信号,胰岛素/ IGF, PI3激酶,FGF信号通路)密切相关。


图  细胞成分GO富集分析

4研究意义

本项研究首次获得一个膀胱癌组织miRNA表达模式的全面概述。这些miRNAs可能参与膀胱癌的肿瘤发生和恶化过程。

5用户文章

Wei Yanping,et al.(2016)Comprehensive investigation of aberrant microRNA profiling in bladder cancer tissues.Tumor Biol.DOI 10.1007/s13277-016-5121-z.

本文的miRNA芯片分析由联川生物协助完成


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